病原微生物样本处理难？简石生物TD431带您一招搞定提取！

病原体以及微生物样本的提取可能面临多种困难，其中包括样本来源的多样性和复杂性，宿主DNA或RNA干扰、微生物低浓度以及环境抑制物质。简石生物带您一招搞定提取！

· 物理方法：使用物理手段如离心、过滤或超声波破碎来去除宿主细胞，从而减少宿主DNA或RNA的含量。但是难控制破碎程度，去宿主不彻底。
· 化学方法：利用化学试剂如盐类、酶或有机溶剂来清除宿主DNA或RNA。例如，利用蛋白酶K消化宿主细胞中的蛋白质，然后通过酚/氯仿提取法或其他方法去除宿主DNA。然而化学方法操作繁琐易引入新的污染。
· 免疫沉淀法：利用特异性抗体对宿主细胞进行识别并沉淀，从而去除宿主DNA或RNA。但是受所使用的特异性抗体制约，存在去除不彻底的问题。
· 分子生物学方法：设计特异性引物或探针，以选择性地放大或检测目标微生物DNA或RNA，从而忽略或减少宿主DNA或RNA的干扰。不过使用分子生物学方法，需要开发特定的引物探针难以批量操作。
· 使用纯化试剂盒：简石的DNA或RNA纯化试剂盒包含专门的缓冲液和材料，简便易操作，可以高效去除宿主DNA或RNA，并提取纯度较高的微生物DNA或RNA。

二、样本处理时微生物低浓度怎么办？

· 浓缩样品：使用浓缩方法，如离心、超滤、沉淀等，将样品中微生物的浓度提高。
· 微生物富集：采用微生物富集方法，如细菌培养、免疫沉淀等，将微生物从样品中富集出来，增加其浓度。
· 使用增效剂：添加增效剂（如聚乙二醇、聚乙烯吡咯烷酮等）来提高微生物DNA或RNA的回收率和浓度。
· 多次提取：重复进行提取操作，然后将提取物进行混合使用，以增加微生物DNA或RNA的浓度。

·  使用低上样量的提取试剂盒：上述方法操作复杂且效果不明显，简石的微生物提取试剂盒可以在样本量低的情况下提取得到高质量核酸，帮助研究人员更好的完成实验。

Host ZERO去宿主DNA提取试剂盒（离心柱法）TD431

简石的Host ZERO®去宿主DNA提取试剂盒（离心柱法）在去除宿主DNA方面，在适用样品类型中宿主DNA去除率高达90%以上。提取出来的DNA完整度可有效回收85%的微生物DNA并且最低程度的对微生物群落造成影响。操作简单快速，只需30分钟。

宿主DNA的去除效率

HostZERO®去宿主DNA提取试剂盒去除了宿主DNA。相同的人类唾液样本是使用HostZERO®去宿主DNA提取试剂盒或供应商Q和M的试剂盒进行处理。纯化的DNA样品通过RT-PCR进行评估。DNA的组成是以相对细菌和人类DNA的丰度显示。对照样品是用HostZERO®去宿主DNA提取试剂盒处理后，从试剂盒中提取总DNA中没有去除宿主DNA。可与我公司的纯化产品配合使用。

如何保留微生物的完整性？

宿主DNA提取时需要保留微生物完整性是因为微生物的完整性对后续分析结果至关重要。微生物的完整性指的是微生物细胞结构和DNA的完整性，它直接影响到提取的DNA质量和分析结果的准确性。

1. 数据偏差：微生物的完整性受损会导致DNA片段的断裂和丢失，从而影响到DNA提取的质量和数量。这可能会引入数据偏差，使得后续分析结果不准确。
2. 数据失真：微生物的完整性受损还可能导致DNA的降解和损伤，影响到DNA的可靠性和稳定性。这可能会导致数据失真，使得分析结果不可靠。
3. 实验重复性：微生物的完整性对实验的重复性和可重复性也至关重要。如果微生物的完整性受损，可能导致实验结果的不稳定性，使得实验无法重复。
因此，在去宿主DNA提取过程中，需要采取适当的方法和措施来最大程度地保留微生物的完整性，以确保提取的DNA质量和后续分析结果的准确性和可靠性。

使用HostZERO®去宿主DNA提取试剂盒处理样品中的微生物成分保持不变。使用HostZERO®去宿主DNA提取试剂盒或供应商的试剂盒Q和M。一式三份的纯化DNA样品进行了分析使用16SrRNA基因靶向测序，使用引物定位到V3-V4区域。得到的扩增子是在IlluminaMiSeq®(2x300bp)上测序。对照样品是用去宿主DNA提取试剂盒处理。

去宿主DNA过程中，保留细菌DNA及后面的细菌DNA回收很重要吗？

首先，保证后续分析准确性：在许多实验中，研究人员不仅需要宿主DNA的信息，还需要了解微生物群的组成和功能。如果不能有效回收细菌DNA，就无法获取关于微生物群的信息，从而可能影响到实验结果的准确性和可靠性。其次，充分利用样本资源：许多实验需要利用样本中的所有信息来进行分析。如果不能有效回收细菌DNA，就会导致样本资源的浪费，从而降低实验的效率和成本效益。最后，提高数据解读的深度：微生物群的组成和功能与许多生物学过程相关联，如健康与疾病、环境适应等。通过有效回收细菌DNA，可以提高对微生物群的理解和解读深度，为相关研究提供更多有价值的信息。

因此，有效回收细菌DNA对于保证实验的准确性、充分利用样本资源以及提高数据解读的深度都是非常必要的。

细菌DNA的回收效率

HostZERO®技术可以有效回收细菌DNA。使用HostZERO®去宿主DNA提取试剂盒或供应商Q和M的试剂盒处理同一个人唾液样品。一式三份的DNA样品通过RT-PCR评估。对照样品用去宿主DNA提取试剂盒处理，该试剂盒可从样品中提取细菌总DNA。